集裝箱底板早先使用的是經防腐處理的實木地板，后逐步被防腐處理的多層膠合板取代。集裝箱底板與普通膠合板的一個主要區別是進行防腐處理，其防腐的含義包括防腐朽和防蟲蛀兩個方面，防腐劑中含有防霉劑和殺蟲劑兩種成分。防腐的目的，一是延長集裝箱底板（木材）的使用年限，使木底板的使用年限與集裝箱的使用年限接近；二是防止有害生物（如木材腐朽菌、木材害蟲）隨集裝箱的流通而傳播。

集裝箱底板的防腐處理包括兩種方法：一是加壓浸漬處理，主要用于實木和單板；二是膠層處理，后者主要用于膠合板和層積材。膠層處理是在膠粘劑中加人防腐劑，在膠合板或層積材的成型和膠合過程中，防腐劑滲透到木材（單板）中，起到防腐的作用。加壓浸漬處理是木材和膠合板防腐處理的方法，也是最有效的方法。是將木材置于一個高壓的容器中，抽出木材中的空氣，將防腐劑深深壓入木材的細胞中。

在木材防腐工業已應用近百年，而且仍是當今各國應用最廣的防腐處理技術。實木加壓浸漬防腐處理很早就被制箱業和衛生檢疫普遍接受，如澳大利亞檢疫檢驗局（AQIS）接受單板防腐處理，然后熱壓制造的膠合板作為集裝箱底板，也接受膠層防腐劑處理的膠合板作為集裝箱底板，但膠合板的（整體）加壓浸漬防腐處理一直未被接受。

膠層處理是用于木質人造板的防腐處理方法。與加壓浸漬處理相比，膠層處理用于生產防腐膠合板，方法簡單、無需增加額外的（防腐處理）設備、無需改變生產工藝，因此近10多年來，防腐膠合板已成為集裝箱底板的主流產品。